В 1983 году недалеко от города Лисаковска в обрыве берега реки Тобол школьник Сергей Яцук нашел глиняный горшок. Археологом А. П. Мазниченко на месте находки были обнаружены жилищные впадины поселения эпохи бронзы. Спасательные археологические раскопки Лисаковского комплекса были начаты в 1985 году. Первоначально они финансировались Лисаковским горно-обогатительным комбинатом (директор Е. Т. Зябрев, заместитель директора А. А. Греф, 1985–1989 гг.). С 1990 года средства на археологические исследования выделялись городскими властями (Лисаковский горисполком, Фонд экономического и социального развития Лисаковской специальной экономической зоны, Фонд экономического и социального развития г. Лисаковска, городской бюджет). В последние годы (2005–2012 гг.) археологические работы осуществлялись при финансовой поддержке Управления культуры акимата Костанайской области.
